正如导演乌尔善所说,《封神三部曲》不但要构建瑰丽的神话世界,更要以深刻的人性刻画为核心。“质子旅”的设定出自中国真实历史,正是通过年轻人的视角去探讨鉴别真伪、抉择善恶的成长历程。导演乌尔善表示:“年轻人们一起成长,都想成为英雄和生命中的胜利者,他们经历不同的事件,做出不同的选择,每个人走向不同的人生。我觉得这样的故事是跨越时代的,对当代的年轻观众来说也很有意义。”该片由立川让(《零的执行人》)执导,樱井武晴编剧,聚焦柯南、灰原哀与黑暗组织之间的纠葛。在园子的邀请下,柯南与少年侦探团一起访问了八丈岛。柯南潜入设施内后,发生了一名女性工程师被黑衣组织绑架的事件,她所拥有的记录某个信息的USB被落入组织手中。而此时身在八丈岛的灰原哀身边,也正有黑影在悄悄靠近。